肺癌是目前全球最常見、致死率最高的惡性腫瘤。GLOBALCAN 2022年的數據,2022年全球肺癌新發(fā)病例數超過200萬,死亡病例數超過170萬,是毫無疑問的全球最常見的癌癥,且是患者發(fā)生腫瘤相關性死亡的主要原因。中國每年新發(fā)肺癌患者占全球1/3,2022年肺癌新發(fā)病例數約為106.06萬,死亡病例數約為73.3萬[1]。
隨著對疾病認識的不斷加深,腫瘤的治療模式也在發(fā)生變革,個體化精準治療模式逐漸成為主流。在NSCLC領域,隨著基因檢測技術的進步和一系列新藥臨床研究的突破,近10年間新發(fā)現的腫瘤驅動基因不斷增多,推動了NSCLC靶向治療藥物的研發(fā)和臨床應用。
在此背景下,傳統(tǒng)基因檢測方法因基因覆蓋有限,存在漏檢的可能性,以及因組織樣本耗竭而影響后續(xù)檢測等方面的缺陷,已不能充分滿足目前的臨床需求。因此全面的腫瘤相關基因檢測方法則成為提升NSCLC患者治療效果及預后的有效手段。中國臨床腫瘤學會(CSCO)NSCLC診療指南也提出應采用經過驗證的檢測方法同時檢測多個驅動基因。美國國家綜合癌癥網絡(NCCN)NSCLC指南則強烈支持通過全面分子測序的結果,指導臨床治療方案的確定。
NCCN和CSCO指南針對NSCLC推薦檢測的biomarker[2,3]
目前常見應用于NSCLC中基因變異檢測的技術包括Sanger測序、熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,FISH)、即時熒光定量聚合酶鏈反應(real time?polymerase chain reaction,RT?PCR)、免疫組織化學(immunohistochemistry,IHC)、二代測序(next generation sequencing)等,如果需進行多基因聯(lián)檢一般主要應用NGS或者PCR平臺。
非小細胞肺癌常用分子病理檢測方法主要特點比較[4]
1、PCR的優(yōu)勢
中國抗癌協(xié)會腫瘤病理專業(yè)委員會分子病理協(xié)作組聯(lián)合國家藥品監(jiān)督管理局醫(yī)療器械技術評審中心臨床與生物統(tǒng)計二部,對我國過去十年肺癌分子檢測臨床應用及我國藥監(jiān)部門相關產品審批情況做了深入研究。根據對49家大型醫(yī)院的調研數據,繪制了2010年至2019年中國大陸地區(qū)非小細胞肺癌分子病理檢測的整體情況。以非小細胞肺癌主要驅動基因EGFR、ALK、ROS1的檢測為例,NGS檢測的陽性率略低于PCR檢測的陽性率。
非小細胞肺癌EGFR、ALK、ROS1陽性率情況[5]
另外一篇《Lung Cancer》上發(fā)表的文章也對PCR試劑及NGS試劑的臨床應用性能進行了頭對頭的比較,數據顯示:PCR試劑在成功率(98.5% vs 87.8%),陽性率(54.9% vs 50.5%)以及檢測周期都優(yōu)于NGS試劑[6]。
2、NGS的優(yōu)勢
一項回顧性研究對比NGS試劑和PCR試劑檢測1312例晚期NSCLC的EGFR變異情況,結果顯示:PCR試劑在罕見突變方面均存在不足[7]。
NGS與RT-qPCR在EGFR突變檢出情況
在《非小細胞肺癌表皮生長因子受體20號外顯子插入突變檢測臨床實踐中國專家共識(2024版)》中提及國外臨床試驗和多項真實世界數據分析均提示,僅使用PCR檢測預計會漏檢約50%的EGFR ex20ins陽性NSCLC患者。理論上NGS可檢出目前已報告的所有ECFR ex20ins 變異形式,因此本共識建議基于NGS的全面測序平臺[8]。
在《非小細胞肺癌融合基因檢測臨床實踐中國專家共識(2023版)》雖沒有明確優(yōu)先推薦NGS平臺,但是在檢測流程圖中優(yōu)先考慮NGS平臺,不可及時再考慮PCR平臺。
晚期初治非小細胞肺癌融合基因檢測臨床推薦路徑[9]
肺癌基因多聯(lián)檢中的PCR和NGS技術各有千秋,它們在肺癌的精準診療中都發(fā)揮著不可或缺的作用。PCR 技術憑借其高靈敏度、快速檢測和低成本的優(yōu)勢,在已知靶點的快速篩查和治療過程中的動態(tài)監(jiān)測方面具有明顯的優(yōu)勢,是肺癌基因檢測領域的“傳統(tǒng)利刃”。而NGS技術則以其高通量檢測、發(fā)現未知突變和適用于復雜樣本的特性,為肺癌患者的全面診斷、新藥研發(fā)以及科研探索開啟了一扇新的大門,成為肺癌精準醫(yī)療發(fā)展的重要推動力量。
但從技術而且并沒有優(yōu)劣之分,只是在不同的應用場景會更加適用,因此需根據患者的具體情況、醫(yī)療機構的技術條件以及檢測的目的和需求,合理選擇PCR或NGS技術進行肺癌基因多聯(lián)檢。
飛朔生物致力于為腫瘤個體化精準診斷提供整體解決方案,包括早期篩查、疾病診斷、個體化用藥指導和療效監(jiān)測等領域,根據肺癌患者不同實際需求有以下檢測套餐推薦:
[1] CA Cancer J Clin. 2024 May-Jun;74(3):229-263.
[2] CSCO非小細胞肺癌診療指南(2024版)
[3] NCCN非小細胞診療指南(2025.v3)
[4] 非小細胞肺癌分子病理檢測臨床實踐指南(2024版)
[5] JTO Clin Res Rep. 2021 Mar 11;2(4):100163
[6] Lung Cancer. 2023 May:179:107190.
[7] Lung Cancer. 2024 Dec:198:108002.
[8] 非小細胞肺癌表皮生長因子受體20號外顯子插入突變檢測臨床實踐中國專家共識(2024版)
[9] 非小細胞肺癌融合基因檢測臨床實踐中國專家共識(2023版)